| センター長 | 光岡 薫 | (超高圧電子顕微鏡センター 教授) | 副センター長 | 山﨑 順 | (超高圧電子顕微鏡センター 教授) | 副センター長 | 荒河 一渡 | (島根大学 教授/超高圧電子顕微鏡センター 特任教授) |
| 運営委員 | ||
| 佐藤 和久 | (超高圧電子顕微鏡センター 准教授) | |
| 八十島 安伸 | (人間科学研究科 教授) | |
| 昆 隆英 | (理学研究科 教授) | |
| 原田 彰宏 | (医学系研究科 教授) | |
| 前田 隆史 | (歯学研究科 准教授) | |
| 有澤 光弘 | (薬学研究科 教授) | |
| 中野 貴由 | (工学研究科 教授) | |
| 片山 竜二 | (工学研究科 教授) | |
| 酒井 朗 | (基礎工学研究科 教授) | |
| 瀬尾 茂人 | (情報科学研究科 准教授) | |
| 淺川 東彦 | (生命機能研究科 准教授) | |
| 東山 真二 | (微生物病研究所 准教授) | |
| 末永 和知 | (産業科学研究所 教授) | |
| 山下 栄樹 | (蛋白質研究所 准教授) | |
| 伊藤 和博 | (接合科学研究所 教授) | 2024年4月1日現在 |